Nadleśnictwo położone jest w północnej części województwa podlaskiego, w powiatach: augustowskim (gmina Nowinka), sejneńskim (gminy: Krasnopol i Puńsk), oraz suwalskim (gminy: Bakałarzewo, Jeleniewo, Przerośl, Rutka-Tartak, Suwałki, Szypliszki i Wiżajny).
Lasy Nadleśnictwa leżą w Krainie Przyrodniczo – Leśnej II Mazursko-Podlaskiej w Mezoregionach Pojezierza Suwalskiego, oraz Wigier i Rospudy.
Pod względem fizjograficznym teren ten obejmuje Pojezierze Zachodniosuwalskie oraz zachodnią część Pojezierza Wschodniosuwalskiego.

Łączna powierzchnia Nadleśnictwa Suwałki wynosi 14 2303,78 ha, natomiast terytorialny zasięg działania wynosi około 131 936 ha.

Łączna powierzchnia Nadleśnictwa Suwałki wynosi 14 303,78 ha, natomiast terytorialny zasięg działania wynosi około 131 936 ha i grunty zarządzane przez Nadleśnictwo Suwałki w odniesieniu do ogólnej sieci geograficznej położone są między 54°25’ a 53°55’ szerokości geograficznej północnej i 22°45’ a 23°15’ długości geograficznej wschodniej. Wysokość bezwzględna omawianego terenu zawiera się w przedziale od 140 m n.p.m. – na tafli Jeziora Postowelek, do 298,1 m n.p.m. na szczycie Rowelskiej Góry, która leży na południowy wschód od Wiżajn.

Całokształt warunków klimatycznych północno-wschodniej Polski wskazuje, że obszar ten stanowi jeden z najchłodniejszych regionów nizinnej Polski. Lato jest nieco cieplejsze, nie wyrównuje to jednak surowych i dłużej trwających zim. Duża odległość Morza Bałtyckiego sprawia, że dominują tu masy powietrza polarnego pochodzenia kontynentalnego lub polarnomorskiego.

W podziale klimatycznym województwa podlaskiego obszar nadleśnictwa znajduje się w regionie Suwalskim oraz subregionach: Garbów Pojeziernych, Suwalsko-Sejneńskim i Wigiersko-Augustowskim. Region ten jest najchłodniejszym obszarem województwa, a także nizinnej części kraju. Wyróżnia się dużymi wahaniami opadów, ze względu na duże zróżnicowanie w rzeźbie terenu. Pokrywa śnieżna zalega tu najdłużej w województwie. Region ten wyróżnia największa w województwie średnia roczna prędkość wiatru, ponad 4 m/s, z dużym udziałem wiatru o prędkościach umiarkowanych i silnych.